甲公司和乙公司均为增值税一般纳税人，适用的增值税税率均为17%。2×18年4月1日，甲公司以一项可供出售金融资产与乙公司一批存货进行交换。可供出售金融资产的账面价值为600万元（成本500万元，公允价值变动100万元），公允价值为800万元，根据相关规定，转让该投资免征增值税；乙公司换出存货的账面价值为600万元，公允价值为800万元（不含增值税），甲公司另支付补价136万元，交换后资产的用途不变

解析：该项非货币性资产交换具有商业实质且换入资产与换出资产的公允价值均能够可靠计量，则应当以公允价值计量非货币资产交换，甲公司为支付补价方。
选项A表述错误，甲公司换入存货成本=800+136-136＋10=810（万元），需要注意的是，甲公司为换入资产支付的运杂费10万元属于应计入换入资产成本的相关税费，需要计入存货成本；
选项B表述正确，甲公司应确认的投资收益金额＝800－600＋100＝300（万元），包括可供出售金融账面价值与公允价值之间的差额200万元与转出因公允价值变动累积确认的其他综合收益100万元两部分；
选项C表述正确，乙公司换入可供出售金融资产的入账价值=800×（1+17%）-136=800（万元）；
选项D表述错误，乙公司换出存货应确认主营业务收入800万元。
综上，本题应选BC。